标题「代号黑色」是一家洛杉矶县医院急诊室（号称是全美国最繁忙的医院）对特殊情况的称呼——当大量病人涌入医院，院方没有足够的人手治疗所有病人时，其中一些病人可能因此死亡。医护人员只能拼尽全力去抢救病人，但最终的结果可能要听天由命。主人公是四名刚刚加入该医院急诊团队的医生，他们一方面艰难地面对有严重缺陷的医疗系统，另一方面竭力保护自己的理想并救治那些最需要他们的病人。很显然，他们在课堂中和书本上学到的东西和真正的急诊室有着天壤之别，更别提那些形形色色的急诊室员工……他们有的会辅导他们，有的会教育他们，但有的会恐吓他们。住院部主任Leanne Rorish医生（Marcia Gay Harden）处在所有混乱的「中心位置」。没有任何人敢轻视或忽视她，仿佛她天生就是个领袖。她专门在医院为最危重病人保留的「中心病房」实施高风险手术，并以不败的神话而享誉盛名。她最近刚刚接受了训练四名新住院医生的任务——Christa Lorenson（Bonnie Somerville）、Malaya Pineda（Melanie Kannokada）、Mario Savetti（Benjamin Hollingsworth）和Angus Leighton（Harry M. Ford）。Christa曾是中产阶级的专职妈妈，儿子死于癌症。她现在是一个刚刚走上新岗位的、有天赋的、专注事业的医生。她在帮助儿子对抗癌症的过程中积累了不少医学经验，再加上她敏感的直觉和多年的生活阅历，使得她看问题的角度和别人不一样。那些年轻医生忽视的细节，往往逃不过她的眼睛。Malaya刚刚在这个繁忙的急诊室内开始自己的实习医生职业生涯。Mario初来乍到，为人热心但骄傲自大。急诊室里的高级护士Jesse Sallander（Luis Guzman）是Leanne最亲密的知己，和善可亲但为人强硬，见过各种大场面，最讨厌别人胡闹。他为四名新来的住院医生服务，但他更像是他们的管家。用他自己的话来说，「在接下来的三年里，我就是你们的老妈……你们的老妈当然知道你们何时在撒谎，何时会哭泣，何时要丧命。」优秀的医生Neal（Raza Jaffrey）也在急诊室里工作，他有时对Leanne的「牛仔」风格并不赞同。他认为医生和病人在感情上取得共识对治疗疾病至关重要，任何用病人的生命冒险的行为都是可恶的。急诊室里的另一名医生Rollie Guthrie（William Allen Young）则是个精力充沛、积极进取、已经干了很多年的主治医生。在「中心病房」里，只有争分夺秒才能抢救生命。现代医学体系已经无法应对「人满为患」的局面，这些英勇的医生和护士们唯有用速度和技能来帮助他们。通常这些患者到这里来只有两种原因——要么在这里等死，要么期待奇迹的发生。