憨厚、纯朴的博士受一次恶梦的启发，用了几年的时间研制出一种隐形药。但见博士服药后，其身体渐渐隐去，椅子上只有衣衫，不见人影，奥妙无穷。博士急忙将这一重大的发明秘密告诉了助手王小燕。而小燕闻听立即吞服了一粒药试验效果，没想到特别灵。小燕兴冲冲地去体育馆观看球赛时，正值大个子的联工队遥遥领先，小个子的科学队却士气低落。小燕见状忿忿不平，便吃了一粒隐身药，跑到赛场内大显神通。只见小小篮球如被人遥控一般，自己飞来飞去，使科学队频频得分，一时间场内观众大哗。博士和小燕决定将发明成果报专利局申请专利，谁知由于错拿了“六神丸”的药瓶，结果在专利局众人面前大丢其丑。博士去饭馆吃饭，偶然认识了饭馆女老板秀兰姑娘。秀兰自作多情，非博士不嫁，可两人的感情和志趣却无法沟通，博士深感烦恼。秀兰的弟弟二国从姐姐那里知道了隐身药的事，欣喜若狂，潜入博士的试验室悄悄偷走了几粒。次日，银行的保险柜在众目睽睽之下被窃，新闻媒介为此作了专题报道。这引起了博士的忧虑。此时专利干部已将博博士申请隐形药专利一事迅速报告了公安局，并协助公安人员追踪破案。二国与赌徒眯眯眼大赌。他不仅将偷来的钱输光，而且还输了自己的耳朵。当二国不得已听从眯眯眼的指使去偷博物馆的金器时，被公安人员发现。二国偷车逃窜，小燕紧跟其后追赶。在一所废弃的工厂里，小燕被眯眯眼一伙抓住。秀兰为寻找弟弟二国也落入了魔爪。与秀兰一同前来的隐身博士被激怒，他大战恶徒们，越打越勇。不料药力渐渐消失，博士最后显身被恶徒们擒拿。关键时刻，公安人员赶到将文物贩子击毙。隐形药的发明给博士带来许多意想不到的烦恼，也给社会和公安部门增添了许多麻烦和不安。博士最终毅然销毁了隐形药，他和助手小燕为此抚掌相视，大笑不已。