「棺材仔」宋慈被村民视为不祥人，靠打更维生，好友查小灿送来红鸡蛋贺他三十岁生日，宋慈感动。翌日宋慈要求村长按乡例三十男丁分田两亩给他，材长指族谱上没有他的名字，不能分田。宋慈忿然告官，好友薛丹来作证人，可惜他非宋家族人且比宋慈年轻三年而无效，县官判宋慈败诉。 米店老板宋诚之子宋翊将回桃园镇出任知县，村长乘机讨好，并挖去宋慈母坟建迎官亭，宋慈怒找村长理论。二人纠缠间，小偷唐思来到找寻遗失的白玉兔，宋诚夫妇刚巧经过，误以为宋慈与唐思一起殴打村长。 其后村长被发现伏尸溪边，宋慈与唐思被控谋杀判斩首，二人押往大牢途中，宋慈被雷电击中身亡，送往义庄安葬。打理义庄的马贵发现宋慈未死，遂救醒他，又说村长并非被打死，宋慈请他帮忙，马贵拒绝并赶他走。突然马贵连声惨叫，宋慈见他头胪肿胀，马贵他去执药救治。马贵见宋慈救了自己一命，答应收留他，二人从村长脚上发现有个钉孔伤口，估计村长中毒而死，此时村长夫人来到，说要取回尸体。

村长夫人领回村长尸体安葬。薛丹和小灿到义庄拜祭宋慈，赫然发现他仍在生，欣喜若狂。宋慈悄悄割下村长脚底伤口皮肤，马贵指村长中了破伤风毒致死，薛丹提议待宋翊履任时拦途申冤。宋翊接到状词，询问捕头聂人龙意见，人龙指出疑点，二人遂跟踪薛丹到义庄，知宋慈未死。宋慈建议再验尸，宋翊接纳。宋翊到狱中向唐思问话，又说会为她翻案，唐思大喜。 宋慈与人龙合作扮鬼吓村长夫人，差点被聂枫搞砸。聂枫重遇儿时玩伴宋翊，但宋翊却似不认得她。宋翊往找村长夫人，夫人一听到宋慈名字即答应开棺验尸。聂枫在亡母坟前诉说因百变飞狐被格去女捕头一职，只好回来找父人龙。她途经义庄时见宋慈，揭穿他扮鬼，押他回衙门。 众人在村长坟前见到宋慈，均吓一跳，村长夫人恍然被宋慈及宋翊整蛊，反对开棺，宋翊坚持开棺，但看到村长尸体即一愕，原来村长尸体已化成白骨，无从验尸。宋慈再被收押候刑，唐思指宋翊骗她。聂枫自知害了宋慈，亲自送来最后晚餐，宋慈吃后双唇肿胀，马贵见状说若将村长骸骨蒸煮，可为宋慈翻案。

宋慈与唐思在狱中互诉辛酸身世，宋慈同情地说要娶她为妻，好让她在阴间有人照护，唐思心头一暖，与他就地拜堂。大刀快斩下的一刻，村长夫人大叫刀下留人，同意煮村长骸骨，以确定是否中毒，最后宋慈、唐思沉冤得雪。 宋慈的更夫工作丢了，惟有义务帮马贵工作，从中学习验尸。唐思与宋慈互相躲避对方，原来怕对方提起狱中拜堂一事，最后双方协议拜堂一事作废。唐思被Du场打手追债，连本带利共二百多两，唐思无计可施下偷了小灿妻宋玲身上银两，小灿追捕被她逃脱。 马贵有感宋慈对验尸有天分，婉拒宋翊邀请他当仵作后推荐宋慈担任，宋翊一怔。宋慈见工失败，沮丧不已，小灿安慰他。宋诚当上新村长，大派烧肉。宋翊见宋慈垂头经过，即当众宣布他是宋家子孙，可分烧肉及田地，又聘请他当仵作，宋慈感激不已。小灿到唐思家追讨银，发现她身上有一白玉兔，直指她是失散二十年的亲妹查小恩。此时Du场打手追来，唐思将错就错跟小灿回家。宋慈与老仵作进行验尸，老仵作指死者吊颈自杀并无可疑，宋慈不认同。