母亲因病而亡的武士之后龙之介，失去了生活的信念，就在他四处彷徨时，被要上京的尊王攘夷派浪士打劫而身无分文。因为没有食物又没有钱，就在龙之介快饿死时，遇上了正要前往京都路上的芹泽鸭，被带回了当时刚成立的新选组（岁三等人刚刚上京），遇见了新八，原田，平助等人。厌恶武士这一职业的龙之介本打算在给恩人（芹泽）道谢后就离开新选组，却半强制地被芹泽收为小厮（主人的狗）帮忙跑腿，声称“报恩就要有个报恩的样”，于是龙之介便留在了新选组。同时新选组内部面临重重危机，芹泽与岁三近藤等人的矛盾即将爆发。

斋藤来到了京城，回到了昔日武道馆的同伴身边，岁三命新八等人前去街上巡逻（还未得到番邦的同意），在街上遇见了为人打抱不平却实际上连剑都不会拔的龙之介，众人赶跑了仗着武士之威欺负平民的浪人。另一方面，为了迎接家茂公入阁，岁三等人前去护卫（实际上并不是真正意义上的护卫，几乎只是围观），但仅仅如此让近藤等人雀跃不已，新的未来仿佛就在眼前。

新八与斋藤在遭遇非法浪人，经历一番激战满身浴血地回到了组里，众人分析了时局的不利性。不久之后会津公收新选组于其羽翼之下，使众人得以堂堂正正上街巡逻。芹泽提出大家一起去花街庆祝，龙之介由此邂逅了言语颇为激烈刺激了芹泽的艺伎小玲，龙之介挺身保护小玲。另一方面岁三制订了新选组的法令，内容及其言明，意图在于限制芹泽等人的肆意行为。