汤姆知道自己的父亲叫霍华德，母亲叫斯科蒂，是国内私人武装承包领域最大公司哈尔西恩的所有人。通过父亲的死讯，汤姆查出自己的真名叫克里斯托夫·哈格里夫，在五岁时被人绑架，并被人刻意伪造成已死亡（《罪恶黑名单》第四季第13集）。线索查到这也就结束了，汤姆不想继续追查，打算安心做个家庭好男人，照顾女儿艾格尼斯和妻子伊丽莎白。可命运注定他摆脱不了冒险生活，一通电话打破了原本宁静的生活。

霍华德的律师打来电话，请汤姆务必于当天抵达纽约，事关他父亲的遗嘱。在伊丽莎白的鼓励下，汤姆来到了纽约，却发生一连串奇怪的事。机场出租车并没有把他送到指定地方，而是在路边电话亭停了车。路边电话突然响了起来，汤姆疑惑的拎起了电话。电话那头对汤姆的身世了如指掌，更奇怪的是电话簿里还夹着汤姆小时候与母亲的合照。汤姆觉得背心一阵寒意，但仍然按照电话要求前往华盛顿公园见面。

在公园长椅上，神秘人物露面了，竟然是已被宣布死亡的霍华德·哈格里夫，汤姆的亲生父亲。霍华德显得很紧张，似乎在躲避某人的跟踪。对于飞机失事，他坚信是有人故意破坏。而那个人正是妻子斯科蒂，目的就是夺取公司的所有权。在之前的三十年里，霍华德从未放弃过寻找儿子克里斯托夫。现在他找到了汤姆，也希望儿子能帮助他夺回公司。这个计划的关键点就在于斯科蒂并不知道汤姆的真实身份，汤姆必须进入公司，卧底在母亲身边，赢得她的信任。

说完这些后，霍华德就匆匆离开。即没说详细计划，也没说为什么斯科蒂会来找汤姆。汤姆正莫名其妙的给伊丽莎白打电话时，几辆警车停在了他的身边，从车上下来的正是斯科蒂。霍华德果然非常了解妻子，斯科蒂接手公司后的第一个任务就想到了汤姆。虽然上次与汤姆相见并不愉快（《罪恶黑名单》第三季第21集），但她对汤姆的能力印象深刻。这次的任务是从变节者利兰·布雷手中救出中情局间谍安娜·科普兰及其年幼的儿子，以免国防安全信息外泄。因安娜的间谍身份，中情局不便出面，必须假手于哈尔西恩公司实施营救。

按照父亲的要求，汤姆跟着母亲斯科蒂走进了隐藏在公司内的秘密指挥室。他诧异的看到马蒂亚斯·所罗门活生生的站在面前，这个曾经试图绑架伊丽莎白的家伙正是斯科蒂的得力手下，也将与汤姆共事。除了所罗门之外，团队里还有两人，擅长特工技巧的内斯和精通电脑技术的杜蒙特，他们就像雷丁顿行动小组里的纳瓦比和阿兰姆。

斯科蒂找到汤姆的另一个原因就是，这次任务里的安娜和利兰都曾和汤姆有过接触。尤其利兰，汤姆知道他有个女友叫纳迪亚。纳迪亚简直就是个女神，利兰对她非常着迷，出入都有专人保护。要想找到利兰就要从纳迪亚下手。内斯先潜入纳迪亚的豪宅，入侵监控系统。杜蒙特则远程监控纳迪亚的动向，指挥正在地下水道里伺机行动的汤姆和所罗门。在杜蒙特的指挥下，汤姆和所罗门合作在游泳池下方安置了小型炸弹。等纳迪亚游到当中，杜蒙特一声令下，泳池底被炸出个大口子。纳迪亚被倾泄而下的池水裹携着，正落入汤姆和所罗门准备好的大网中。

绑架很成功，可如何得到布雷的下落却不容易。斯科蒂也不想毁了纳迪亚的容貌，唯有趁她昏迷之际在她的眼睛里放上一枚隐形眼镜。通过这枚高科技眼镜，杜蒙特能实时接收到纳迪亚所看到的内容。之后就是提供纳迪亚逃跑的机会，汤姆和所罗门为如何审讯“大打出手”，纳迪亚就是借这个机会逃之夭夭。杜蒙特很快从屏幕上看到逃走的纳迪亚在路边拨打公用电话，调查电话号码，利兰的下落就一清二楚。

利兰在距离伦敦百余公里的郊外，一所戒备森严的庄园内。在英国历史上，为了防范拿破仑曾经挖掘过很复杂的地下隧道。从利兰所在庄园的方位来看，正处在隧道之上，这可能也是利兰秘密转移人质而不被人发现的原因，如今这些隧道也成了汤姆攻入庄园的最佳选择。可又出现了一个问题，如何在迷宫般的地下隧道里找到出口。而相关的历史文献被博物馆收藏，其中有详细的隧道地图。要想拿到这么珍贵的文献，斯科蒂几人也是费尽周折，从盗取复制门禁卡，到进入机密保管室，各人充分配合，终于拍到了隧道地图照片。

有了地图，进入庄园解救安娜变得异乎寻常的顺利。除了半当中，纳迪亚在洗脸时发现隐形眼镜，导致利兰有所警觉，让所罗门和内斯多费了些手脚，整个过程基本没有碰上像样的抵抗。而实际上利兰得到纳迪亚的通知，首先想到劫持安娜的儿子为人质，以拖延时间是有目的的。正是这相差的一小时时间里，被汤姆解救的安娜从医院逃了出去。这时汤姆才从医院的X光照片里发现，安娜身上的伤口并不是因为酷刑，而是在身体里置入了炸药。

考虑到利兰变节的原因是因为对原情报团队的不满，安娜很可能是以为儿子仍在利兰手中，所以才从医院逃走，去完成剩下的任务，炸毁中情局驻伦敦的情报团队。幸亏所罗门和内斯及时赶到，才说服安娜放下手中的引爆器。

任务完成了，可汤姆心头的疑惑却没有解开。从这几天的相处，汤姆感觉到母亲对父亲仍念念不忘，葬礼上流下的眼泪也不像是在装模作样。每当母亲谈起父亲时，嘴角的微笑不似作假。只有在讲到最后几年时，她才会表现出一丝怨恨。在斯科蒂看来，霍华德不愿接受儿子已经死亡的事实，执着的寻找让他变得越来越偏执而神秘。坠机前的几个月，在董事会宣布霍华德不能再胜任管理公司的职务后，他就消失无踪，直至飞机坠毁。

到底母亲是阴险狡诈的蛇蝎毒妇，还是说父亲因偏执产生了错觉，汤姆也无法分辨。他决定继续留在纽约，寻找父亲与母亲之间的真相。

哈尔西恩公司在私人武装承包领域绝对称得上首屈一指，时常要替政府部门做些不能曝光的灰色任务。也正因如此，斯科蒂才有胆气，不顾国务院的反对，派人潜入柯基斯坦国拯救记者凯文。凯文曾是克里斯托夫幼年时的同学，两家关系一向不错。自从克里斯托夫被确认死亡后，斯科蒂就像对待自己的孩子一样呵护着凯文。凯文以新闻专业毕业后，就在世界各国调查报导人权状况。当他在柯基斯坦国采访时，被当地政府以间谍罪入狱。斯科蒂很清楚这种国家没有司法公正可言，国务院所谓的外交手段不会有任何作用。只有展开手术刀式的精准营救行动，才能保证凯文回国。

柯基斯坦目前正处于政治混乱状态，现任总统为获得连任，大肆镇压反对者并关闭了国境线。除了要考虑如何秘密潜入，还要解决如何把凯文从最高安全等级监狱中救出来，最后如何安全离境。就在商量行动方案时，柯基斯坦在网上公布了凯文的认罪录像。视频中凯文承认自己是效力于中情局的特工，但这反而让斯科蒂更加担心他的安危。这种屈打成招的后果就是被执行枪决，必须尽快行动。所罗门等人长期从事这种灰色行动，习以为常。倒是新加入的汤姆比他们更积极，因为他想从凯文那探听自己小时候的事情。

于是行动方案很快确定，首先是所罗门与内斯以欧盟外交官的身份进入柯基斯坦，在真正的外交官抵达前，营救出凯文。这一部分通过杜蒙特拦截篡改电子文件，很顺利的让所罗门和内斯进入了柯基斯坦的国境。可负责运输武器的汤姆却遇到了麻烦，原本计划截获往返于柯基斯坦和亚美尼亚之间的货车，装上需用装备和掩饰用仪器过边境。没想到就在边境检查时，仪器出现问题，被检查人员发现异常。汤姆只好弃车逃过边境，全部装备被收缴。

汤姆只身翻越国境，没能带进来装备。斯科蒂只能安排他与就近的地下武器商碰头，可允诺了苛刻的条件，也只得到了两把AK47和两弹匣的子弹。汤姆看着这两把枪只有苦笑，在这种情况下只能另辟溪径。柯基斯坦现在实施严酷镇压，只要有人举报某人在说总统的坏话，被举报人就会被投入监狱。这种看来不可思议的文字狱，却给汤姆带来了机会。在武器商的帮助下，汤姆、所罗门穿着警服，内斯开着警车，跟着其他警车浩浩荡荡的开进了监狱。因为有人举报监狱长和管理人员在私下议论总统，所以警方要进行大规模搜查。汤姆和所罗门就这样大摇大摆的走进监狱，寻找被关押的凯文。凯文找到了，但爆破牢门的声音引来了真正的警察。汤姆和所罗门凭着两支AK和不多的子弹，从厨房后门杀出监狱，跳上内斯驾驶的警车扬长而去。

整个营救行动到此算是有惊无险的圆满成功，却没想到凯文执意取回藏在公寓里的采访资料，一个人偷偷从安全屋跑了出来。这种敬业精神值得赞赏，但也很愚蠢。凯文刚回所住的公寓楼，就被眼线发现。等汤姆三人找到他时，警车也呼啸而来。此时手里仅剩手枪，几个人开车一路躲避警察的围追堵截，直奔美国大使馆而去。事到如今，国务院也无法坐视不理，只能允许大使馆开放大门，驻守的海军陆战队随时待命。

柯基斯坦警方也防备着凯文逃进大使馆，已在大使馆门外设卡拦截。内斯一脚油门冲向挡在前面的警车，冲开路障的同时，车辆也熄了火。紧随而来的枪林弹雨让凯文腹部中弹，所罗门和内斯架着他奔入大使馆，汤姆返身回到车旁抢回了凯文视为生命的采访资料。大门外的海军陆战队严辞拒绝向警方交出任何美国公民，大门内军医则在抢救已失去意识的凯文。但凯文没能坚持下来，将生命留在了他曾奋斗的地方。

任务失败和无法寻找童年的双重打击，让汤姆很失落。同样，斯科蒂也陷入悲痛，就像再次失去了自己的儿子。可让她难以接受的是，中情局事后确认凯文的确是以记者身份为掩护的特工，凯文平板电脑和相机里保存的所谓采访资料，都是搜集到的机密情报。作为一名为国捐躯的间谍，凯文不能公开真实身份，中情局的纪念墙上也不会有他的荣耀勋章。这大概就是秘密特工的宿命，永远生活在阳光之下的宿命。

菲利普斯将军专程来找斯科蒂，商量有关“北极星行动”。他军装上那四颗星，完全可以证明该计划的重要性。可斯科蒂却根本不知道这项军方与霍华德已策划了几个月的秘密计划，根据军方提供的资料她才明白来龙去脉。

原来美国卫星在俄罗斯中部的乌拉尔山脉旁发现一处小镇，但飞行器探测却没有显示。一个小镇需要用电子干扰防备高空监视，这不能不让美国情报部门有所疑心。因此军方与霍华德准备策划一起空难事故，坠机地点就在小镇旁边，借调查事故的机会进行近距离拍摄。目前军方借助远程遥控技术，将一架载有十几具尸体的双引擎飞机坠落在指定地点。官方文件确认该飞机是用于国际救援，俄罗斯政府为避免纠纷只能请国际运输安全委员会赴现场调查事故原因。汤姆和所罗门以调查员身份抵达了现场，开始侦查工作。所罗门趁人不备割开油管，制造燃油泄露爆燃。汤姆趁乱离开现场，穿过丛林潜伏在小镇附近远距离拍摄内部情况，并在俄罗斯军队发现前及时撤离。

汤姆拍摄到的照片有些诡异。小镇表面上看很普通，可内部都是英文标识，并插着美国国旗，镇口木牌上用英文写着“独立镇”。小镇上居民的装束、车辆以及店铺装修风格与普通的美国小镇没有区别，这让斯科蒂首先想到的就是冷战期间苏联人翻造美国小镇用以培训能融入美国社会的特工。但这是很古老的方法，现在全球联网的身份系统让这样的特工无所遁形。要想弄清楚小镇里的秘密，必须派人进去卧底。能办成此事的只有瓦迪姆，一名被斯科蒂握有把柄的俄罗斯联邦安全局特工。

在瓦迪姆的推荐下，汤姆和内斯以联邦安全局探员身份卧底“独立镇”培训计划。在出发前，汤姆和霍华德见了次面，因为汤姆总有些担心。汤姆曾偷听到斯科蒂与助理凯特的对话，知道霍华德服用过抗抑郁类药物，并在自行停药后行为变得异常。而且斯科蒂正在重新审核霍华德签过的合同、每一笔账目，看看霍华德还隐瞒了什么秘密。汤姆担心斯科蒂会追查到他的真实身份，可霍华德不愿谈这些，而是更关心“北极星行动”，要求汤姆务必前往独立镇。霍华德这样遮遮掩掩的态度，让汤姆有些无所是从，感觉无法看透自己的父亲和母亲。

汤姆和内斯按计划在莫斯科等候专人接头。一辆面包车驶来，经过搜身核对暗号后，两人上了车，跟车上其他人一起来到位于深山中的独立镇。进入小镇前，各人的私人物品全部没收，换上提供的衣物，并进行复杂的登记、拍照工作。随后各人被分配新的身份，进入小镇。按规定，只允许饮用配发的瓶装水，也只能讲英语。内斯喝了一口水就知道有问题，她曾因战后心理创伤服用过很多药物，还因此上瘾。是霍华德帮助她戒毒，所以才进入了哈尔西恩公司。她知道瓶装水中含有微量药物，让饮用者降低戒心，易于服从安排。

汤姆以指定的身份回到“家”，手上还带着配发的结婚戒指。不得不佩服“妻子”辛西娅的专业精神，她的体贴温柔，就像已和汤姆结婚多年。辛西娅带着汤姆一起拜访邻居，参加生日宴会。这些居民除了偶尔会被一些美国俚语难住之外，根本看不出与普通美国人有何区别。内斯的新身份有个弟弟皮特，可就在内斯进入小镇的第二天，皮特就被转移去美国。临走前，皮特并不开心，偷偷的告诉“姐姐”此去就再也不会回来。这句如同诀别的话，让内斯心生诧异。

小镇里看似平静，其实处处有摄像头和监听设备。汤姆假装四处闲逛，寻找指挥中心的地点。此时内斯接到所谓银行面试的电话，其实是要测试她对身份的熟悉程度。不过面试人员除了问些问题，还动手动脚。内斯忍无可忍，狠狠教训了他一顿。就在内斯以为会招惹怀疑时，她好斗的性格反而让培训主管觉得她已适合执行任务。当内斯看到任务资料时才知道自己被指派的身份并非虚构，在美国的确有这样一个人。此人的外貌、肤色、身材与内斯非常相似，只需做几个小整容手术，内斯就可以完全替代她，在美国以合法身份开展间谍活动。

既然已经知道了独立镇的秘密，就必须尽快将相关情报送到哈尔西恩，何况内斯也不希望自己脸上被人动刀子。最快的方法就是找到指挥中心，将其中的数据发送给杜蒙特。汤姆和内斯趁着夜深人静时分，偷偷来到小镇市政厅，指挥中心就在市政厅的地下。由于联邦安全局从未想到自己培训的特工里会有美国特工混入，汤姆和内斯轻而易举的就控制了指挥中心。不过汤姆也有一件事没有考虑到，他刚从床上起身，一旁“熟睡”的妻子就睁开了双眼。这里本身就是间谍的世界，对你再温柔的人也会随时变成另一副面孔。

培训指挥官在接到辛西娅的举报后，立刻采取行动，切断了指挥中心内部网络，并派出武装人员包围指挥中心。杜蒙特利用短暂的接收时间，查到包括皮特在内的三名被派往美国的“独立镇”特工，以此为线索成功解除一次炸弹袭击威胁。可汤姆和内斯却要靠自己冲出指挥中心，就在俄罗斯武装小队在指挥中心的闸门前安置炸药准备爆破时，门内的汤姆突发灵感，将高压电线连在闸门上。随着电闸拉下，闸门瞬间附带上万伏特电压。雷管受电流影响提前引爆，没有心理准备未来得及隐蔽的武装人员被自己的炸药炸得支离破碎。逃出市政厅的汤姆碰到了拿着手枪的妻子辛西娅。辛西娅要为了祖国“大义灭亲”，只可惜被找到逃生车辆的内斯撞飞，没能完成杀敌心愿。

汤姆和内斯在救援小组的帮助下顺利回到美国，第二天卫星照片上就显示“独立镇”只剩下一个大坑，被完全从地球上抹去。死里逃生的汤姆却还在担心另一件事，斯科蒂是否有所发现。汤姆和内斯在独立镇的几天里，斯科蒂和所罗门也没闲着。凯特查到公司的CFO替霍华德建立秘密账户，进而查到账户的钱流向一名隐藏极深的中情局间谍。在重金利诱下，间谍说出了霍华德在寻找儿子，并提供了当初提供给霍华德的资料。现在斯科蒂也知道自己的儿子还没死，誓要找到儿子克里斯托夫。

斯科蒂的发现，让汤姆暗暗心惊，他找到父亲霍华德。可霍华德还是那副态度，只关心“北极星行动”的成果。当他听到“独立镇”培养的特工替代真实存在的美国人后，提出了更耸人听闻的想法。在克里斯托夫失踪的两个月后，斯科蒂曾发生严重车祸，在医院呆了几个月时间。出院后的斯科蒂就变得和以前不一样，霍华德相信真正的斯科蒂已死于三十年前的那场车祸，现在的斯科蒂就是来自“独立镇”的替身。